Forskel mellem upstream og downstream DNA | Upstream vs Downstream DNA

Nøgleforskel - Upstream vs Downstream DNA

Det er vigtigt at have en generel viden om DNAs sammensætning og struktur for at forstå forskellen mellem upstream og downstream DNA. DNA er sammensat af polynukleotidkæder. Nucleotider er byggestenene, der skaber polynukleotidkæder, og hvert nukleotid er fremstillet af tre komponenter: et fem-carbon-sukker, en nitrogenbaseret base og en phosphatgruppe. En phosphatgruppe og en OH-gruppe er fæstnet til henholdsvis 5'-position carbon og 3'-position carbon af sukkermolekylet i henholdsvis et nucleotid. Nukleotider forbindes sammen af ​​phosphodiesterbindinger dannet mellem 5'-phosphatgruppen af ​​et nukleotid og 3'-OH-gruppe af det tilstødende nukleotid. Hvis en polynukleotidkæde har en fri 5'-phosphatgruppe, tildeles den som 5'-enden; hvis den har en fri 3'-OH-gruppe, er den tildelt som en 3'-ende. Derfor har DNA-tråde sædvanligvis 5'- og 3'-ender i overensstemmelse med endepositionerne af polynukleotidkæderne. DNA eksisterer også som dobbeltstrenget form. To tråde er antiparallelle til hinanden. Derfor har DNA to tråde, der løber hen imod retningen 5 'til 3' og 3 'til 5'. Upstream og downstream DNA refereres med henvisning til transkription og syntese af 5 'til 3' mRNA streng. Hvis DNA betragtes mod 5-enden af ​​kodningsstrengen fra transkriptionsinitiationsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra kodningsstrengen fra transkriptionsinitieringsstedet, er kendt som downstream DNA . Dette er nøgleforskellen mellem upstream og downstream DNA.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel

2. Hvad er Upstream DNA

3. Hvad er Downstream DNA

4. Sammenligning ved siden af ​​hinanden - Upstream vs Downstream DNA

5. Sammendrag

Hvad er Upstream DNA?

Et gen er en strukturel og funktionel enhed arvelighed, som er placeret på DNA fra en organisme. Den opbevares med instruktioner til at konstruere et protein. Genet har en specifik region af et DNA-molekyle. Om nødvendigt transskriberes og translateres det til et protein via syntese af en mRNA-streng. Normalt løber en kodende streng af genet fra 5 'til 3' retning. Når den transkriberes, producerer den en mRNA-streng i samme retning 5 'til 3'. Under transkriptionen serveres 3 'til 5' antisense streng som templatstrengen og initierer mRNA-syntesen. Der er et transkriptionsinitieringssted i genet. Med henvisning til transkriptionsinitieringsstedet er DNA-regionen mod 5'-enden af ​​den kodende streng kendt som opstrøms DNA.En promotor af genet ligger normalt i DNA'ens opstrømsregion. I eukaryotiske gener er der TATA-kasser, promotor-proximale elementer og forstærkere i området opstrøms for genet. Opstrømsregionen af ​​genet henvises til negative tal. Upstream DNA af et gen er af største betydning for transkriptionen.

Hvad er Downstream DNA?

Transkriptionsinitieringssted er kendt som +1 punkt for et gen. DNA-regionen fra +1 peger mod 3'-enden af ​​kodningsstrengen er kendt som nedstrøms DNA. Med andre ord er nedstrøms for genet fra transkriptionsinitieringsstedet mod 5'-enden af ​​skabelonstrengen. Derfor omfatter nedstrøms DNA i et genområde transkriptionsenhed og andre sekvenser, såsom terminatorsekvens. Promotoren kan påvirke den nedstrøms sekvens af et gen. Nedstrømsdelen af ​​et gen henvises til positive tal. Nedstrøms DNA fra et gen er den egentlige region, som giver proteinproduktet.

Figur 01: Upstream og Downstream DNA

Hvad er forskellen mellem Upstream og Downstream DNA?

- diff Artikel Mellem før tabel ->

Upstream vs Downstream DNA
DNA-regionen mod 5'-enden af ​​den kodende sekvens fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som opstrøms DNA.	DNA-regionen mod 3'-enden af ​​kodningsstrengen fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som nedstrøms DNA.
Elementer
Promotorer og forstærkere er placeret på upstream DNA	Transkriptionsenheden, og terminatorsekvenserne er placeret i downstream-DNA'et.
Nummerering
Nucleotider i opstrømsregionen henvises til med negative tal	Nucleotider refereres med positive tal.
Funktion
Denne region indeholder elementer, der er nødvendige for at regulere og initiere transkription	Denne region indeholder instruktion til at producere et protein og afslutte transkriptionen

Sammendrag - Opstrøms vs Nedstrøms DNA

Det er let at identificere opstrøms og nedstrøms for en RNA-streng. Med hensyn til referencestedet er regionen mod 5'-enden af ​​RNA-strengen kendt som opstrøms-RNA, medens området mod 3'-enden er kendt som nedstrøms-RNA. I DNA er der imidlertid to tråde, som løber i begge retninger 5 'til 3' og 3 'til 5'. Derfor er forskellen mellem upstream og downstream DNA kompliceret. Derfor differentieres den med henvisning til transkriptionen af ​​et gen. Fra transkriptionsinitieringsstedet mod den 5 ende af sensestrengen er DNA-regionen kendt som opstrøms-DNA, hvorimod fra transkriptionsinitieringsstedet mod 3'-enden af ​​sensestrengen er kendt som nedstrøms DNA. Dette er forskellen mellem upstream og downstream af DNA.

Referencer:

1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi og Jonatha M. Gott. "Forskellige roller for sekvenser opstrøms og nedstrøms fra Physarumediting sites. "RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18. marts 2017

Billede Courtesy:

1.Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro og Luísa Romão. "Gene Expression Regulation ved Upstream Open Reading Frames og Human Disease. "PLOS Genetics. Public Library of Science, n. d. Web. 18. marts 2017.