Forskel mellem Metabolomics og Metabonomics | Metabolomics vs Metabonomics
Nøgleforskel - Metabolomics vs Metabonomics
Metabolitter er de små molekyler, der er involveret i metaboliske reaktioner i cellerne. Metabolitter indbefatter metaboliske mellemprodukter, hormoner, sekundære metabolitter, signalmolekyler mv. De er de fungerende molekyler af biokemiske reaktioner af cellerne. Et komplet sæt metabolitter af en biologisk prøve eller en enkelt organisme er kendt som metabolom. Metabolom er en dynamisk samling, der ændrer hvert sekund i kroppen. Metabolomics og metabonomics er to termer relateret til undersøgelsen af metabolisme af en organisme. Hovedforskellen mellem metabolomik og metabonomi er, at metabolomik er mere bekymret over normal endogen metabolisme og metabolisk profilering på et cellulært eller organniveau mens metabonomi er mere bekymret over at udvide metabolisk profilering med informationen forstyrrelser af metabolisme på grund af miljøfaktorer, sygdomme, tarmmikroorganismer og sammenligning af metabolisk profilering mv. Metabolomics er primært drevet af massespektrometri, og metabonomi bruger NMR-spektroskopi til metabolitanalyse.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Metabolomics
3. Hvad er Metabonomics
4. Side om side Sammenligning - Metabolomics vs Metabonomics
5. Sammendrag
Hvad er Metabolomics?
Metabolomics er undersøgelsen af metaboliske processer, der forekommer i celler, biofluider, væv eller organismer. Det omfatter identifikation og kvantificering af cellulære metabolitter ved brug af gode analytiske og statistiske værktøjer. Metabolomics betragtes som en vigtig undersøgelse, da det afslører information om stofskiftet af en organisme.
For at studere substrater og produkter af metaboliske reaktioner bruger metabolomics massespektrometri som analytisk platform. Massespektrometri afslører typer af metabolitter og deres koncentrationer, hvilket afspejler den faktiske biokemiske tilstand af cellerne eller vævene. Derfor kan metabolomics betragtes som den bedste repræsentant for molekylær fænotype af en organisme. Metabolomics er en omisk teknologi af små molekyler af organismerne og sammenlignet med andre omiske undersøgelser; metabolomics er meget vigtig, da den direkte reflekterer den nuværende status for cellernes biokemiske reaktion.
Metabolomics kan også betragtes som en forlængelse af proteomics, fordi de genereres på grund af aktiviteterne af enzymer, der er proteiner som vist i den følgende figur.
Figur 01: Metabolomics-skema
Hvad er Metabonomics?
Metabonomi defineres som en kvantitativ måling af multiparametriske metaboliske reaktioner på bestemte tidspunkter i relation til patofysiologiske stress eller genetisk modifikation. Dette anvendes normalt til undersøgelser udført om menneskelig ernæring og reaktioner på stoffer eller sygdomme. Denne tilgang blev pionereret af Jeremy Nicholson på Imperial College i London, og den er blevet brugt på en række områder, herunder toksikologi, sygdomsdiagnose, ernæring osv. Historisk var metabonomi en af de første metoder til at anvende anvendelsesområdet for systembiologi til studier af stofskiftet.
Metabonomi er mere bekymret over at sammenligne biokemiske profiler end at identificere individuelle metaboliske forbindelser i metabolomics. Derfor kan metabonomi defineres som en delmængde af metabolomics. Det fremhæver hovedsagelig sammenligningen af metaboliske profiler af forskellige populationer med hensyn til sygdomme, miljøbelastninger, genetisk modifikation, ernæring, medicin osv., Fordi metabolitter er de gode markører, der signalerer sygdomsbetingelserne, virkningerne af lægemidler, miljøbelastninger, eksponering for toksiner, etc.
Metabonomiske studier afslører både intracellulære og ekstracellulære metabolitter. Det anvender højtydende teknikker til at analysere et stort antal metabolitter samtidig og gentagne gange, hvilket muliggør tidsmæssig undersøgelse af cellens fysiologiske status. Det afslører også korrelationen mellem metabolitter og patologisk status af organismen. For at understøtte metabonomiske studier kan genomik og proteomik anvendes, da de er indbyrdes forbundne som vist i ovenstående figur.
Hvad er forskellen mellem Metabolomics og Metabonomics?
Metabolomics er undersøgelsen af det komplette sæt metabolitter af en organisme.
Metabonomi er den kvantitative undersøgelse af multiparametriske metaboliske reaktioner af levende systemer i tidsmæssig basis til patofysiologiske stimuli eller genetisk modifikation. |
|
Hovedbekymring | Metabolomics er mere bekymret over metabolisk profilering og identifikation af individuelle metabolitter, der er til stede i cellerne. |
Metabonomi er mere interesseret i at sammenligne metabolitter eller metaboliske profiler af populationer i forhold til genetiske modifikationer, sygdomme, miljøbelastninger, patologiske stimuli, narkotika mv. | |
Information | Metabolomics er primært fokuseret på endogent metabolisme. |
Metabonomi er ikke begrænset til endogent metabolisme. Det strækker sig efter at finde oplysninger om forstyrrelser af metabolisme forårsaget af interne og eksterne faktorer som kostmønstre, toksiner, sygdomsprocesser mv. | |
Analytiske værktøjer | Det bruger massespektrometri som den primære analytiske platform |
Metabonomics bruger NMR spektroskopi som den vigtigste analytiske platform. | |
Sammendrag - Metabolomics vs Metabonomics | Metabolom repræsenterer det komplette sæt små molekyler, der kaldes metabolitter, der er til stede i en celle eller i en organisme.Metabolomics er undersøgelsen af hele metabolomet for at generere metabolsk profil. Metabolomics gør det muligt for forskere at måle den faktiske fysiologiske status af cellen eller organismen. Metabonomi er en del af metabolomics, der udvider til at udtrække information om de multiparametriske metaboliske reaktioner hos levende systemer til patofysiologiske stimuli og genetiske modifikationer. Metabonomi er ikke kun berørt af individuel metabolisk profilering som metabolomics; det sammenligner metaboliske profiler i forhold til andre faktorer som miljøbelastninger, sygdomme, toksiner mv. Både metabolomik og metabonomi involverer undersøgelser af organismernes metabolitter for at måle cellernes faktiske fysiologiske status. Derfor er disse to gange undertiden betragtet som synonymer uden at overveje forskellen mellem metabolomik og metabonomi. |
Reference:
1. Roessner, Ute og Jairus Bowne. "Hvad handler metabolomics om. "BioTechniques - Hvad handler metabolomics om? N. p., April 2009. Web. 24. april 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomics and Metabonomics. "Springer. Springer London, 01 jan. 1970. Web. 25. april 2017
Billede Courtesy:
1. "Metabolomics schema" Af LMaps (talk) - eget arbejde (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia