Forskel mellem rødt og ikke-rødt phylogenetisk træ | Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Hovedforskel - Rødt vs. Usorteret Phylogenetisk Træ
Phylogeny er et vigtigt felt, der udforsker livet på jorden gennem tiden. Det afslører forbindelsen mellem organismer med deres forfædre og efterkommere. Forholdet mellem organismer er skematisk repræsenteret af forskellige trælignende repræsentationer som dendogram, kladogram, fænogram, phylogram osv. Et fylogenetisk træ er et forgrenende trælignende diagram, der forklarer de fylogenetiske forhold mellem organismer med mængden af evolutionær afstand. Der er to hovedtyper af fylogenetiske træer kendt som rodfæstet og unrooted. Nøgleforskellen mellem det rodfæstede og det ikke-styrede fylogenetiske træ er, at rodetræ viser den mest basale forfader for træet mens ikke-rødt fylogenetisk træ ikke viser en forfædres rod.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er et roten filogenetisk træ
3. Hvad er et unrooted fylogenetisk træ
4. Sammenligning ved siden af hinanden - Rødt mod ubeskyttet fylogenetisk træ
5. Sammendrag
Hvad er et roten filogenetisk træ?
Et roteret fylogenetisk træ tjener som et nyttigt diagram, der viser evolutionær historien. Den har en basal knude, der kaldes roten, der repræsenterer den fælles forfader for alle grupper af træet. Roten af et træ betragtes som det ældste punkt i træet, som repræsenterer den sidste fælles forfader for alle grupper indgår i træet. Derfor viser et rodet træde retningen for evolutionstiden. Fra en enkelt art af et rodfæstet træ kan den fælles forfædre eller artens forfader findes ved at spore tilbage til basalnoden. Da det rodede træ skildrer retningen for evolutionstiden, er det let at finde de ældre eller nyere grupper, den har. Et rodet træ kan bruges til at studere hele grupper af organismer. Præcis rotation af et fylogenetisk træ er en vigtig og afgørende faktor, da unøjagtig rødning kan resultere i forkerte fortolkninger af genetiske ændringer mellem organismer og deres retningsstyrke i evolutionen.
Figur 01: Et rødt fylogenetisk træ
Hvad er et ufortyndet fylogenetisk træ?
Et ufortyndet fylogenetisk træ er et fylogenetisk diagram, der mangler en fælles forfader eller en basal knudepunkt. Denne type af et træ angiver ikke udviklingen af de interesserede grupper.Det viser kun forholdet mellem organismer uanset retningen af den evolutionære tidslinje. Derfor er det svært at studere gruppernes evolutionære relationer i forhold til tid ved hjælp af et urørt træ.
Der er to hovedmåder til at rotere et ubeskyttet fylogenetisk træ. De er
- Finde en outgroup - Dette kræver forudgående viden om forholdet mellem taxa. Derefter kan et taxon uden for gruppen bruges som en udgruppe til at tegne et rodet fylogenetisk træ.
- Find midtpunktet eller afstanden - Midterpunktet for de fjerneste to taxa i træet kan antages som en rod for det fylogenetiske træ.
Figur 02: Et ufortyndet fylogenetisk træ
Hvad er forskellen mellem rødt og ikke-rødt phylogenetisk træ?
- diff Artikkel Mellem før Tabel ->
Rødt vs Ubemærket Phylogenetisk Træ |
|
| Et rodet fylogenetisk træ er et diagram, der viser gruppens sidste fælles forfader. | Et ufortyndet fylogenetisk træ viser forholdet mellem organismer uden at vise den fælles forfader. |
| Node | |
| Det har en node (root). | Det har ikke en node. |
| Evolutionens retning | |
| Den har en retning til at indikere evolutionstiden. | Det angiver ikke et evolutionært forhold. |
| Hengivenhed over for andre | |
| Træet tillader at bestemme forfædrenes efterkommere forhold mellem grupper. | Træet tillader ikke at tale om forfader - efterkommere forhold. |
Sammendrag - Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Et fylogenetisk træ repræsenterer de evolutionære veje og forbindelser mellem organismer ved hjælp af forgrenede trælignende diagrammer. Phylogenetiske tress kan være forankret eller unrooted. Et rodet træ har en knude på bunden, der repræsenterer den fælles forfader, der forbinder alle interessegrupper. Et urørt træ viser forholdet mellem organismer. Det skildrer imidlertid ikke den fælles forfader, som alle grupper deler. Dette er forskellen mellem rodfæstet og ikke-rødt fylogenetisk træ.
Referencer:
1. "Træ" Fakta: Rødt mod Unrooted Trees. "National Center for Bioteknologi Information. S. National Library of Medicine, n. d. Web. 4. april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead og Spencer C. H. Barrett. "Rooting Phylogenetic Trees with Distant Outgroups: En case study fra Commelinoid Monocots. "Molekylærbiologi og Evolution. Oxford University Press, 01 okt 2002. Web. 04 april 2017
