Forskel mellem VNTR og STR | VNTR vs STR
Nøgleforskel - VNTR vs STR
DNA-undersøgelser har en stor nytte i forståelse og bestemmelse af fylogenetiske relationer, diagnosticering af genetiske sygdomme og kortlægning af organismernes genomer. Flere teknikker forbundet med DNA-analyse anvendes til identifikationen af et bestemt gen eller en DNA-sekvens i en pulje af ukendt DNA. De er kendt som genetiske markører. Genetiske markører anvendes i molekylærbiologi for at identificere genetisk variation mellem individer og arter. Variabelt tal tandem repeat (VNTR) og kort tandem repeat (STR) er to typer af genetiske markører, der viser polymorfi blandt individer. Begge typer er ikke-kodende gentagende DNA, som er tandem-gentagelser. De er arrangeret i hoved til hale mode i kromosomer. VNTR er en sektion af genomet, hvor kort nukleotidsekvens gentages flere gange. STR er et andet afsnit af DNA inden for genomet, som er organiseret som gentagende enheder bestående af to til tretten nukleotider i hundrede gange. Nøgleforskellen mellem VNTR og STR er antallet af nukleotider i en gentagende sekvens. Repeterende enheder af VNTR består af 10 til 100 nukleotider, mens gentagende enhed af STR består af 2 til 13 nukleotider . VNTR og STR anvendes bredt i retsmedicinske studier.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er VNTR
3. Hvad er STR
4. Ligheder mellem VNTR og STR
5. Side om side Sammenligning - VNTR vs STR i tabelform
6. Sammendrag
Hvad er VNTR?
En tandem-gentagelse er en kort sekvens af DNA, der gentages i hoved til hale mode på et specifikt kromosomalt locus. Der er ingen anden sekvens eller nukleotid inden for tandem-gentagen. Der er flere typer tandem gentagelser i genomet. VNTR er en type tandem-gentagelse blandt dem, der har gentagende enheder bestående af 10 til 100 nukleotider. VNTR er en type minisatellit. Disse tandem gentagelser findes i mange kromosomer. De er interspersed inden for det humane genom og ligger overvejende i de subtelomere regioner af kromosomer.
VNTR'er viser tandem-gentagelsespolymorfi blandt individer. Længden af VNTR i en bestemt placering af kromosomet er stærkt variabel blandt individer på grund af variationen i antallet af gentagende enheder organiseret i den DNA-sektion. Derfor kan VNTR bruges som et kraftfuldt værktøj til identifikation af enkeltpersoner, og VNTR-analysen anvendes på mange områder, herunder genetik, biologi forskning, retsmedicin og DNA-fingerprintning.VNTR'er var de første genetiske markører anvendt til at kvantificere knoglemarvstransplantations engraftment. VNTR'er var også de første polymorfe markører anvendt i DNA-profilering i retsmedicin.
Figur 3: Variation af VNTR'er hos seks individer
VNTR-analyse udføres via polymorfisme med restriktionsfragmentlængde efterfulgt af sydlig hybridisering. Derfor behøver det forholdsvis en stor DNA-prøve. VNTR profil fortolkning er også problematisk. På grund af disse begrænsninger er brugen af VNTR i retsmedicin genetisk begrænset, og den er erstattet af STR analyse.
Hvad er STR?
STR er en meget repetitiv DNA-sektion, der består af to til tretten nukleotid-gentagende enheder organiseret på tandem måde. STR svarer til VNTR. Men det varierer fra VNTR fra antallet af nukleotider i en gentagende sekvens og antallet af gentagelser. STR er en type mikrosatellit.
STR analyse involveret i måling af det nøjagtige antal gentagne enheder. STR'er er meget variable blandt enkeltpersoner, svarende til VNT'er. STR profiler er forskellige fra person til person. Derfor anvendes STR-analyse i molekylærbiologi til at sammenligne specifikke loci på DNA fra to eller flere prøver. Derfor anses STRs for at være stærke genetiske markører i molekylærbiologi. Det giver et fremragende redskab til identifikation af individer på grund af deres høje grad af polymorfisme og relativt kort længde.
STRs er i øjeblikket det mest anvendte analyserede genetiske polymorfisme værktøj i retsmedicin. De fleste retsmedicinske sagsbehandlinger involverer STR polymorf analyse. STR loci spredes gennem genomet. Der er tusindvis af STR'er placeret i kromosomer, der kan anvendes i retsmedicinsk analyse. STR analyse involverer ikke restriktionslængde-polymorfisme som VNTR-analyse. STR-analyse skærer ikke DNA med restriktionsenzymer. Specifikke prober anvendes til at vedhæfte ønskede regioner på DNA og ved anvendelse af PCR-teknik, bestemmes længderne af STR.
Figur 02: STR variation mellem prøver
Hvad er lighederne mellem VNTR og STR?
VNTR og STR er ikke-kodende DNA.
- Begge er tandem gentagelser.
- Begge viser polymorfi blandt individer på grund af forskellen i længden af DNA-sektionen.
- Begge anvendes som kraftige genetiske markører i DNA fingerprintning og i retsmedicinske undersøgelser.
- Hvad er forskellen mellem VNTR og STR?
- diff Artikel Mellem før tabel ->
VNTR vs STR
VNTR er et ikke-kodende gentaget DNA, som har en kort nukleotidsekvens gentaget på tandem måde. |
|
| STR er en meget repetitiv DNA-sektion, der består af to til tretten nukleotid-gentagende enheder organiseret på tandem måde. | Størrelse |
| VNTR'er er større end STRs. | |
| STR er mindre end VNTRs. | Antal nukleotider i gentagen sekvens |
| Den repeaterende enhed af VNTR består af 10 til 100 nukleotider. | |
| Den gentagende enhed af STR består af 2 til 13 nukleotider. | Sammenfatning - VNTR vs STR |
VNTR og STR er to kraftige genetiske markører anvendt i molekylærbiologi, især inden for retsmedicinsk genetik.VNTR er en type minisatellit og STR er en mikrosatellit. VNTR og STR er ikke-kodende, højt repeterende DNA. De er tandem gentagelser. Den generelle struktur af VNTR og STR er den samme. Antallet af nukleotider i den gentagende sekvens og længden er imidlertid forskellige. VNTR har gentagne sekvenser består af 10 til 100 nukleotider. STR har gentagende sekvenser bestående af 2 til 13 nukleotider. Dette er forskellen mellem VNTR og STR.
Download PDF Version af VNTR vs STR
Du kan downloade PDF-versionen af denne artikel og bruge den til offline-formål som i citatnotater. Venligst download PDF version her Forskel mellem VNTR og STR.
Referencer:
1. "The Science of Forensic Genetics. "CRG - Rådet for ansvarlig genetik. N. p., n. d. Web. Tilgængelig her. 10. juli 2017.
2. "STR analyse. "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22. marts 2017. Web. Tilgængelig her. 10. juli 2017.
Image Courtesy:
