Forskel mellem Alpha Helix og Beta Plated Sheet | Alpha Helix og Beta Plisseret Blad
Nøgleforskel - Alfa Helix vs Beta Plisseret Blad
Alfa Helixer og Beta-plisserede plader er de to mest almindelige sekundære strukturer i en polypeptidkæde. Disse to strukturelle komponenter er de første hovedtrin i processen med foldning af en polypeptidkæde. nøgleforskellen mellem Alpha Helix og Beta Plated Sheet er i deres struktur ; de har to forskellige former for at gøre et bestemt job.
Hvad er Alpha Helix?
En alfa helix er en højrehåndet spiral af aminosyrerester på en polypeptidkæde. Området af aminosyrerester kan variere fra 4 til 40 rester. De hydrogenbindinger dannet mellem oxygenet af C = O-gruppen på topspolen og hydrogenet af N-H-gruppen i bundspolen hjælper med at holde spolen sammen. En hydrogenbinding dannes pr. Hver fire aminosyrerester i kæden på ovennævnte måde. Dette ensartede mønster giver det bestemte funktioner som tykkelsen af spolen og dikterer længden af hver komplet tur langs helixaksen. Stabiliteten af alfa-helixstruktur afhænger af flere faktorer.
O-atomer i rødt, N-atomer i blåt og hydrogenbindinger som grønne stiplede linjer
Hvad er Beta-plettet ark?
Beta plettet ark, også kendt som betaplade, betragtes som den anden form for sekundær struktur i proteiner. Den indeholder beta-tråde, der er forbundet sideværts med mindst to eller tre rygrad hydrogenbindinger for at danne et snoet plettet ark som vist på billedet. En beta-streng er en strækning af polypeptidkæde; dens længde er generelt lig med 3 til 10 aminosyrer, herunder rygrad i en udvidet bekræftelse.
4-strenget antiparallelt β-arkfragment fra en krystalstruktur af enzymkatalasen.
a) viser de antiparallelle hydrogenbindinger (stiplet) mellem peptid-NH- og CO-grupper på tilstødende tråde. Pile angiver kædedrift, og elektrontæthedskonturerne skitserer ikke-H-atomer. O-atomer er røde bolde, N-atomer er blå, og H-atomer udelades for enkelhed; sidekæder vises kun ud til det første sidekæde C-atom (grøn)
b) Kanten på de centrale to β-strenge
I beta-plisserede ark løber polypeptidkæderne sammen med hinanden. Det bliver navnet "plisseret ark" på grund af strukturets bølgelignende udseende. De er forbundet sammen af hydrogenbindinger.Denne struktur tillader dannelse af flere hydrogenbindinger ved at strække ud polypeptidkæden.
Hvad er forskellen mellem Alpha Helix og Beta Plated Sheet?
Struktur af Alpha Helix og Beta Plisseret Blad
Alpha Helix:
I denne struktur er polypeptid backbone tæt bundet omkring en imaginær akse som en spiral struktur. Det er også kendt som den helikoidale arrangement af peptidkæden.
Dannelsen af alfa-helixstruktur sker, når polypeptidkæderne snoet i en spiral. Dette gør det muligt for alle aminosyrer i kæden at danne hydrogenbindinger (en binding mellem et oxygenmolekyle og et hydrogenmolekyle) med hinanden. Hydrogenbindingerne tillader spiralen at holde spiralformen og giver en stram spole. Denne spiralform gør alfa-helixen meget stærk.
Hydrogenbindinger er angivet med de gule prikker.
Beta-plettet ark:
Når to eller flere fragmenter af polypeptidkæderne overlapper hinanden, danner en række hydrogenbindinger med hinanden, kan følgende strukturer findes. Det kan ske på to måder; parallel arrangement og anti-parallel arrangement.
Eksempler på strukturen:
Alpha Helix: Fingernails eller tånegle kan tages som et eksempel på en alfa-helixstruktur.
Beta-plettet ark: Firkantens struktur svarer til strukturen af beta-plisseret ark.
Funktioner af strukturen:
Alfa Helix: I alfa helix struktur er der 3,6 aminosyrer pr. Drejning af helixen. Alle peptidbindingerne er trans og plane, og N-H-grupperne i peptidbindingerne peger i samme retning, hvilket er omtrent parallelt med helixens akse. C = O-grupperne af alle peptidbindinger peger i den modsatte retning, og de er parallelle med spiralaksen. C = O-gruppen af hver peptidbinding er bundet til N-H-gruppen af peptidbindingen, der danner en hydrogenbinding. Alle R-grupper peges udad fra helixen.
Beta-plettet ark: Hver peptidbinding i beta-plettet ark er plan og har trans-konformation. C = O- og N-H-grupperne af peptidbindinger fra tilstødende kæder er i samme plan og peger mod hinanden, der danner hydrogenbinding mellem dem. Alle R-grupperne i en hvilken som helst kæde kan alternativt forekomme over og under pladens plan.
Definitioner:
Sekundær struktur: Det er formen af et foldende protein på grund af hydrogenbinding mellem dets rygradamid og carbonylgrupper.
Referencer: "Proteinstruktur". ChemWiki: Den sekundære struktur af den dynamiske kemi Hypertext "A-Helices and P-Sheets". Proteinstructures. com af Salam Al Karadaghi "Organisk kemi". Den virtuelle celle lærebog "Beta Sheet". Wikipedia Image Courtesy: "Helix electron density density myoglobin 2nrl 17-32" Af Dcrjsr - Egent arbejde (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia "Protein sekundær struktur" af en: Bruger: Bikadi (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia "1gwe antipar beta ark begge" af Dcrjsr - eget arbejde (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia
