Forskel mellem transposon og retrotransposon
Transposon vs Retrotransposon
Transposoner og retrotransposoner er genetiske komponenter af DNA, og der er store forskelle mellem dem. Procentandelen af disse genetiske materialer varierer på tværs af arter, og deres funktioner bestemmer organismernes skæbne med mutationer og andre fænotypisk vigtige ændringer. Transposoner og retrotransposoner er gener eller samlinger af visse gener, der er placeret i DNA-strengene, og ændringer af deres lokaliteter har været hovedårsagerne til disse konsekvenser. Men denne artikel har til hensigt at diskutere disse genes funktioner kort og præsenterer en sammenligning mellem transposoner og retrotransposons.
Hvad er Transposon?
Transposoner er interessante fragmenter eller segmenter af DNA med evnen til at ændre DNA-strengens placering i form af cut-and-paste-mekanisme. På grund af denne mobile karakter af transposoner er disse kendt som hoppende gener. Transposoner er af to hovedtyper kendt som klasse I transposoner og klasse II transposoner. Normalt henvises klasse II-typen som transposonerne, og klassen I-typen henvises til som retrotransposonerne. Processerne til opskæring og indsætning af mobile DNA-segmenter reguleres af enzymetransposasen. Enzymet binder til transposons begge ender og skærer DNA-strengens phosphodiesterbindinger, isolerer transposonet, flytter det til målstedet og binder på den nye placering. Denne proces er imidlertid interessant at forstå, da nogle transposoner kun kan bevæge sig til bestemte steder på grund af inkompatibiliteten af basissekvenser med målstedet. Gener med den ene ende af en enkelt streng har den samme basesekvens, med den anden ende af den anden enkeltstreng transponerer med klæbrede kanter, fordi de kan binde til målene DNA-strengens steder med den samme basesekvens som i de klæbrige ender. Denne bevægelighed af gener kan imidlertid forårsage ændringer af genotypen såvel som i fænotypen af organismen. Forskere opfundet om transposoner og genetisk modificerede fødevarer og organismer ifølge de foretrukne tilpasninger blev derefter stillet til rådighed. Meget produktive landbrugsafgrøder, antibiotika med medicinske egenskaber, husdyr var nogle af de fordelagtigt udviklede produkter efter opfindelsen af transposoner af Barbara McClintock i 1940'erne.
Hvad er Retrotransposon?
Retrotransposoner er klasse I transposoner, og disse bevæger sig gennem genomet ved hjælp af kopimekanismen. Mekanismen for retrotransposons mobilitet involverer få store trin, såsom kopiering af DNA-strengens gensegment til RNA, overførsel af kopien af RNA til målstedet, transkription af RNA-sekvensen tilbage til DNA ved anvendelse af revers transkriptase og indsættelse af genet til den nye placering af DNA-streng af genom.De to ender af disse retrotransposoner har sædvanligvis lange terminale gentagelser med ca. 1000 basepar, og de anvendes som identifikationsfunktioner af disse gener. Disse gener amplificeres let inde i genomet, og procentdelen af retrotransposonerne i det humane genom er ca. 50%. Disse kan være ret farlige, da den forårsagende virus af AIDS, HIV og T-celle-leukæmivirus har retrotransposonerne i deres RNA-genomer. Faktisk kan disse vira binde retrotransposonerne til et hvilket som helst sted af de humane DNA-tråde ved anvendelse af revers transkriptase og integrase. Integrasenzymet fungerer på samme måde som transposase i klasse II transposoner.
|
Hvad er forskellen mellem Transposon og Retrotransposon? • Transposoner er klasse II-hoppende gener, mens retrotransposoner falder i kategorien i klasse I. • Transposons funktion med transposase enzymet, hvorimod retrotransposoner virker ved anvendelse af to hoved enzymer kendt som revers transkriptase og integrase. • Terminalenderne er meget længere i retrotransposoner end i transposoner. • Transposoner skæres fra oprindelsen og indsættes på målet; omvendt kopieres retrotransposoner fra oprindelsen til RNA og transkriberes ved målet. • Flytningen af retrotransposoner indebærer RNA, men ikke i transposoner. |
