Forskel mellem gelelektroforese og SDS side | Gel Electrophoresis vs SDS Page

Nøgleforskel - Gelelektroforese vs SDS Side

Gelelektroforese er en teknik, der adskiller makromolekyler i et elektrisk felt. Det er en fælles metode i molekylærbiologi at adskille DNA, RNA og proteiner fra blandinger i henhold til deres molekylære størrelser. SDS Page er en type gelelektroforese, som bruges til at adskille proteiner fra en proteinblanding baseret på deres størrelser. Gelelektroforese er et udtryk, der anvendes til at henvise til den normale teknik anvendt til DNA, RNA og proteinseparation , mens SDS Page er en en type gelelektroforese. Dette er nøgleforskellen mellem gelelektroforese og SDS Page.

INDHOLD

1. Oversigt og nøgleforskel

2. Hvad er Gel Electrophoresis

3. Hvad er SDS Page

4. Side ved side sammenligning - Gelelektroforese vs SDS Side

5. Sammendrag

Hvad er Gel Electrophoresis?

Gelelektroforese er en almindelig teknik, der anvendes i laboratorier til separering af ladede molekyler, såsom DNA, RNA, proteiner mv fra deres blandinger. En gel anvendes i gelelektroforese. Det virker som en molekylsigte. Der er to typer geler, der anvendes i gelelektroforese, nemlig agarose og polyacrylamid. Udvælgelse af et gel- og gelpræparat er vigtige faktorer, der skal overvejes ved gelelektroforese, da gelens porestørrelse skal omhyggeligt manipuleres for en god adskillelse af molekyler gennem gelelektroforese. Gelelektroforese har et elektrisk felt forbundet til to ender af gelen. Den ene ende af gelen viser en positiv ladning, mens den anden ende er negativt ladet.

DNA og RNA er negativt ladede molekyler. Når de er fyldt i gelen fra den negative ende af gelen og påført på det elektriske felt, migrerer de gennem gelporerne mod den positivt ladede ende af gelen. Migrationens hastighed afhænger af ladningen og størrelsen af molekylet. Mindre molekyler migrerer let gennem gel porerne end større molekyler. Derfor rejser mindre molekyler en lang afstand gennem gelen, og de større molekyler rejser en kort afstand. For at observere montering af molekyler på gelen anvendes særlige typer farvestoffer. Det elektriske felt påføres i en vis tidsperiode og stoppes for at forhindre tab af molekyler og holde molekylerne i deres rejste positioner. Forskellige bånd kan observeres i gelen.Disse bånd repræsenterer molekylerne af forskellige størrelser. Derfor er gelelektroforese nyttigt at differentiere molekyler i overensstemmelse med deres størrelser.

Gelelektroforese inkorporeres i forskellige teknikker som en præparativ teknik i molekylærbiologi, såsom PCR, RFLP, kloning, DNA-sekventering, sydlig blotting, genomkorting mv.

Figur 01: Agarosegel elektroforese

Hvad er SDS-side?

Natriumdodecylsulfatpolyacrylamidgelelektroforese (SDS Page) er en type gelelektroforese, der anvendes til at separere proteiner. Når gelelektroforese anvendes til at adskille proteiner, er der behov for specielle behandlinger, da proteiner ikke er negativt ladede som DNA og RNA og ikke migrerer mod den positive ende eller den negative ende. Derfor denatureres proteiner og belægges med en negativ ladning forud for gelelektroforese. Det gøres ved hjælp af et vaskemiddel kaldet natriumdodecylsulfat (SDS). Gelelektroforeseen, som anvender SDS og en polyacrylamidgel til det bærende medium, er kendt som SDS Page. Denne teknik er almindeligt anvendt i biokemi, genetik, retsmedicin og molekylærbiologi.

Under SDS Page blandes proteiner med SDS. SDS udfolder proteiner i en lineær form og belæg dem med en negativ ladning proportional med deres molekylmasse. På grund af den negative ladning migrere proteinmolekyler mod den positive ladningsende af gelen og adskilles i overensstemmelse med deres molekylmasser. I SDS Page anvendes polyacrylamid som den faste bærer til gelen. Den egentlige adskillelse af proteinerne afhænger hovedsageligt af gelens egenskaber. Derfor bør polyacrylamidgelpræparatet omhyggeligt udføres, og korrekte koncentrationer af polyacrylamid bør anvendes. Polyacrylamidgeler viser høj opløsning end agarosegeler. Derfor betragtes SDS Page som en højopløsningsmetode til proteinseparation.

SDS Page er en type denaturerende gelelektroforese. Det har en stor begrænsning i proteinanalyse. Da SDS denaturerer proteiner forud for adskillelse, tillader det ikke detektion af enzymatisk aktivitet, proteinbindingsinteraktioner, proteinkofaktorer mv.

Figur 02: SDS side

Hvad er forskellen mellem Gel Electrophoresis og SDS Page?

- diff Artikel Mellem før Tabel ->

Gelelektroforese vs SDS Side
Gelelektroforese er en metode, der udføres for at adskille makromolekyler ved anvendelse af et elektrisk felt.	SDS Page er en højopløselig gelelektroforese teknik, der anvendes til at adskille proteiner baseret på deres masse.
Gel Run
Det kan udføres horisontalt eller vertikalt.	SDS Page kører altid lodret.
Basis for adskillelse
Adskillelse sker efter ladning og størrelse.	Proteinseparation sker i henhold til masse og ladning.
Opløsning
Agarosegelelektroforese har lav opløsning og polyacrylamidgelelektroforese har en højere opløsning	SDS Page har en bedre opløsning.
Denaturering
Gelelektroforese indbefatter både denaturerende og ikke-denaturerende teknikker.	SDS Page denaturerer proteiner forud for separation.

Sammendrag - Gelelektroforese vs SDS Side

Gelelektroforese er en almindelig teknik, der anvendes til separation og analyse af DNA, RNA og proteiner baseret på deres størrelse og ladning. Der er to hovedtyper af gelelektroforese, nemlig agarosegelelektroforese og polyacrylamidgelelektroforese. Agarosegeler anvendes primært til nukleinsyreseparation; Når der kræves højere opløsning, anvendes polyacrylamidgeler. SDS Page er en type gelelektroforese, der almindeligvis anvendes til at adskille komplekse blandinger af proteiner. Det betragtes som en højopløsningsproteinseparationsteknik. Dette er forskellen mellem gelelektroforese og SDS Page.

Referencer:

1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig og David H. Petering. "Nativ SDS-PAGE: Højopløsningselektroforetisk adskillelse af proteiner med tilbageholdelse af native egenskaber, herunder bundet metalioner. www. NCBI. NLM. NIH. gov. N. p., Maj 2014. Web. 7. april 2017

2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforese af DNA i agarosegeler, polyacrylamidgeler og i fri opløsning. "Electrophoresis. U. S. National Library of Medicine, juni 2009. Web. 07. april 2017

Billede Courtesy:

1. "Gelelektrophoreseapparatur" (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia

2. "DNA Agarose gelelektroforese" Ved Naturforvaltningsskolen fra Ann Arbor - DNA lab (CC BY 2. 0) via Commons Wikimedia